프로테오믹스(단백질체학) 기술 플랫폼 기업 베르티스가 중소벤처기업부의 스케일업 팁스 특화형에 선정돼 신약 타깃 발굴 플랫폼 고도화에 나선다.

베르티스는 15일 중소벤처기업부와 중소기업기술정보진흥원이 주관하는 스케일업 팁스 특화형에 선정됐다고 밝혔다.

베르티스는 프로테오믹스 기반 기술력과 상용화 실적을 바탕으로 삼성 계열의 기업형 벤처캐피털(CVC)인 삼성벤처투자의 추천을 받았다. 이후 투자사들이 추천한 기업 간 경쟁 평가를 거쳐 최종 선정됐다.

스케일업 팁스는 성장 단계에 있는 기술집약형 중소벤처기업을 대상으로 민간투자와 정부 연구개발(R&D)을 연계해 기술 고도화와 사업화를 지원하는 프로그램이다. 특화형은 바이오 등 국가 전략기술 분야에 전문성을 갖춘 특화 운영사가 참여하는 유형이다.

베르티스는 이번 선정으로 2029년 8월까지 3년간 정부 연구개발(R&D) 지원금 30억원을 받는다. 이를 통해 표면단백체 분석 기술 기반 신규 약물 타깃 개발 플랫폼 과제를 수행한다. 베르티스의 신약 타깃 발굴 플랫폼 SURF를 고도화하는 과제다.

데이터 생산부터 타깃 발굴·검증, 패키지화에 이르는 신약개발 플랫폼 전 과정을 개선한다. 검증된 신규 타깃과 타깃 조합을 지속적으로 확보해 자산화하고 글로벌 제약사의 신약개발 파트너로서 입지를 강화한다는 계획이다.

SURF는 베르티스가 축적해 온 프로테오믹스와 인공지능(AI) 역량을 기반으로 새로운 표면단백질 타깃을 발굴하는 플랫폼이다. 치료제 개발 과정에서 발생할 수 있는 위험 요인을 타깃 선정 단계에서부터 줄인다. 단백체 데이터를 직접 생산해 후보 발굴부터 우선순위 선정과 검증, 후속 개발을 위한 근거 확보까지 하나의 흐름으로 이어지도록 설계됐다.

개별 표면단백질을 넘어 인접 단백질까지 분석 범위를 넓힌다. 새로운 타깃 후보와 함께 서로 가까이 존재하는 단백질을 동시에 겨냥하는 이중·다중항체 등 차세대 치료제 개발에 활용할 수 있는 근거를 확보할 수 있다.

베르티스는 이번 과제를 통해 다양한 암종의 세포주를 대상으로 표면단백체 데이터베이스를 구축한다. 플랫폼을 통해 도출한 신규 타깃 후보의 세포·조직 수준 발현 특성과 기능을 검증한다. 이후 검증된 타깃과 이에 결합하는 리간드를 포함한 신약 타깃 패키지를 개발한다.

제약사가 항체-약물접합체(ADC), 이중항체 등 다양한 치료제 개발에 활용할 수 있는 형태로 제공할 계획이다. 세포 표면단백질은 항체-약물접합체(ADC), 이중항체 등 다양한 치료 모달리티의 표적이 될 수 있어 신약개발 분야에서 중요한 타깃 발굴 영역으로 주목받고 있다.

임상 단계 항체-약물접합체(ADC) 파이프라인이 일부 주요 표면단백질에 집중되면서 글로벌 제약업계에서는 차별화된 신규 타깃과 함께 개발 가능성과 모달리티 적합성을 판단할 수 있는 측정·검증 근거에 대한 수요가 커지고 있다.

베르티스는 실험 데이터에 기반한 검증 근거를 갖춘 타깃 패키지로 이러한 수요에 대응한다. 제약사와의 공동연구와 기술이전으로 사업화를 확대해 나간다.

한승만 베르티스 대표는 "표면단백체는 차세대 치료제 개발의 핵심 영역으로 현재 글로벌 제약 산업이 가장 주목하는 분야 중 하나"라며 "이번 스케일업 팁스 특화형 선정을 계기로 SURF를 고도화해 표면단백체 기반 신약 타깃 발굴 시장을 선점하고 한국에서 발굴한 타깃이 글로벌 신약개발의 출발점이 되는 K바이오의 새로운 경쟁력을 만들어 나가겠다"고 말했다.

베르티스는 지난 7월 한국보건산업진흥원과 한국MSD가 공동 개최한 'MSD 헬스 이노베이션 서밋'에서 SURF를 처음 공개하고 심사위원단 선정기업으로 수상했다.